Aparentemente para melhorar suas chances pra deputado federal, Esmerino Arruda resolveu disputar a Prefeitura de Fortaleza, em 1962, porém só obteve o quinto lugar, atrás de Murillo Borges, o eleito, Péricles Moreira da Rocha, segundo, Moura Beleza, terceiro, e José Cláudio Oliveira, quarto. Esmerino foi reconduzido à Câmara numa das últimas vagas.
